ساخت هر فروند B-2 Spirit به دلایل مختلف از جمله فناوریهای پنهانکاری، پژوهش و توسعه و تولید بسیار پیچیده، هزینهای بیش از حدود ۲٫۱ میلیارد دلار آمریکا داشته است. این رقم شامل کل هزینه توسعه، مهندسی و پشتیبانی اولیه نیز میشود.
به همین دلیل هزینه ساعت پرواز B-2 Spirit بسیار بالاست و این شامل مواردی فراتر از فقط سوخت میشود. بر اساس دادههای تحلیلگران هوافضا، هزینه عملیاتی هر ساعت پرواز این بمبافکن حدود ۱۳۵,۰۰۰ دلار آمریکا یا بیشتر تخمین زده میشود. رقمی که بسیار بالاتر از اغلب هواپیماهای دیگر در نیروی هوایی است.
بعضی منابع برآوردهایی حتی بالاتر تا حدود ۱۵۰,۰۰۰ دلار یا بیشتر در هر ساعت پرواز را نیز گزارش دادهاند اما این برآوردها بسته به روش محاسبه و گنجاندن یا حذف برخی هزینهها متفاوت هستند.