هنیه 62 ساله در یک اردوگاه پناهندگان در نزدیکی شهر غزه به دنیا آمد و در اواخر دهه 1980 در جریان انتفاضه اول به حماس پیوست.
با رشد قدرت حماس، هنیه در سال 2004 به عنوان بخشی از یک "رهبری جمعی" مخفی منصوب شد و سپس در سال 2006 به عنوان نخست‌وزیر تشکیلات خودگردان فلسطین معرفی شد.
در سال 2017 او رئیس این گروه شد و بلافاصله پس از آن توسط آمریکا در لیست گروه های تروریستی معرفی شد.
طی سال‌ها، او در گفت‌وگوهای صلح با جیمی کارتر، رئیس‌جمهور سابق ایالات متحده، شرکت کرد و در اوایل سال جاری با دیگر رهبران جهان از جمله امیر قطر، شیخ حمد بن خلیفه آل ثانی، و وانگ جیان، دیپلمات چینی دیدار کرد.
پیش از این در پی حملات هوایی اسرائیل به غزه سه پسر هنیه و چهار نوه او به شهادت رسیده بودند.
در آن زمان، هنیه که مقیم قطر بود تاکید داشت که شهادت آنها بر آتش‌بس و مذاکرات گروگان‌ها تأثیری نخواهد داشت.
او گفت: «هرکس فکر می‌کند با هدف قرار دادن فرزندان من در جریان مذاکرات و قبل از توافق بر سر آتش بس، حماس را مجبور به عقب‌نشینی از خواسته‌هایش می‌کند، متوهم است».